Première approche à partir du gène mitochondrial 12S ARNr.
En 1992, Duellman et Hoogmoed ont décrit une nouvelle espèce de rainette du Guyana: Hyla hadroceps. Des spécimens de rainettes arboricoles capturés en Guyane française ressemblent beaucoup au type de Hyla hadroceps (K.H. Jungfer, com. pers.). Toutefois, les caractéristiques générales, la forme et le comportement de ces grenouilles guyanaises se rapprochent beaucoup de celles des membres du genre Trachycephalus. Cette constatation nous a conduit à étudier (1) les relations d'Hyla hadroceps avec le genre Trachycephalus; (2) le statut taxinomique du genre Trachycephalus au sein de la famille des Hylidés dont la polyphylie a déjà été démontrée (Ruvinsky et Maxson, 1996).
Comme la variabilité géographique de ce nouveau taxon (Hyla hadroceps) reste encore peu connue, nous avons utilisé des caractères génétiques, choisissant le gène d'ADN ribosomique 12S du génome mitochondrial. Nous avons utilisé des spécimens de Trachycephalus resinifictrix, P. coriacea et P. venulosa de Guyane française et de P. resinifictrix du Brésil et de l'Équateur (K.H. Jungfer, récolteur). Nous avons ajouté Leptodactylus myersi (de Guyane française), et une Hyla meridionalis du midi de la France. Nos séquences ont également été comparées avec des données issues de banques de gènes: deux espèces de Rana, deux espèces de Bufo et Ceratophrys ornata.
Un fragment de 961 nucléotides a été amplifié et séquencé. La variabilité des différentes séquences a nécessité l'introduction de nombreux évènements "d'insertion /délétion" pour aboutir à un alignement correct. Concernant l'homologie, nous avons seulement tenu compte des substitutions (transitions et transversions). Les reconstitutions phylogénétiques ont été faites en utilisant à la fois les méthodes du maximum de vraisemblance et du minimum d'évolution (GTR estimateur).
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Les spécimens de Guyane française classés comme Hyla hadroceps appartiennent sans nul doute au genre Trachycephalus et doivent être appelés Trachycephalus hadroceps. |
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Les espèces du genre Trachycephalus (hadroceps, resinifictrix, coriaceus et venulosus) forment un clade mono phylétique. Les spécimens de Trachycephalus resinifictrix d'origines géographiques différentes (Brésil, Équateur, Guyane française) ont un faible niveau de divergence génétique. |
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Trachycephalus hadroceps et P. resinifictrix sont étroitement liés, et plus éloignés des deux autres espèces P.coriacea et P. venulosa. |
MATÉRIEL et MÉTHODOLOGIE :
Les réactions de séquences ont été faites selon le protocole P/N402078 du Kit "ABI PRISM™ Dye Terminator. Les produits de séquence ont été analysés avec un séquenceur automatique ABI prism 310. Les séquences utilisées sont un consensus des séquences des deux brins d'ADN.
L'alignement a été effectué manuellement avec "BioEdit"
La matrice initiale a été étudiée avec le logiciel "MUST" (1993). Sur les 961 sites étudiés, 503 étaient variables et 284 informatifs.
Les reconstructions phylogénétiques ont été faites avec: -Le logiciel "PUZZLE" (1966) en utilisant la méthode du maximum de ressemblance. -Le logiciel "PAUP" (1997) avec deux méthodes: minimum d'évolution /maximum de parcimonie. Dans tous les cas, le nombre de réplications ("bootstrap") a été fixé à 1000.
REMERCIEMENTS : Tous nos remerciements à Karl Heinz Jungfer pour son aimable don de tissus, à Patricia Sourouille pour son aide technique et à Pierre-Yves Vaucher pour l'autorisation d'utiliser sa photo !